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01
无公害农产品，它是指这样的农产品，其产地环境符合国家有关标准和规范要求，其生产过程也符合国家有关标准和规范要求，产品质量同样符合国家有关标准和规范要求，它是经认证合格获得认证证书的农产品，它是允许使用无公害农产品标志的农产品，它又是未经加工或者初加工的食用农产品。
02
绿色食品是指，产自优良生态环境的食品，按照绿色食品标准生产的食品，实行全程质量控制的食品，获得绿色食品标志使用权的食品，是安全、优质的食用农产品及相关产品。
绿色食品分为两个等级，即A级标准和AA级标准。
A级绿色食品，需生态环境质量符合规定标准，为其生产过程，要允许限量、限时间、限定方法使用限定种类的化学合成物质，还得按特定的操作规程去进行生产、加工，其产品质量及包装经检验、检测符合特定标准，然后经专门机构认定，许可使用A级绿色食品标志，这样才是A级绿色食品标志的产品。
AA级绿色食品，是指环境质量符合规定标准要求的产品，其生产过程中禁止使用任何有害化学合成物质，需按特定操作规程进行生产、加工，而且产品质量及包装经检验、检测符合特定标准，还要经专门机构认定，许可使用AA级绿色食品标志。AA级绿色食品标准已经达到甚至超过国际有机农业运动联盟规定的有机产品基本要求。
03
有机食品是指，以有机农业方式生产的农副产品及其加工品，符合有关有机标准要求，通过专门认证机构认证，且经过该专门认证机构监管的食品。
异同点
相同点
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（1）三者皆是以食品的质量安全作为基本目标，着重强调食品生产“从土地到餐桌”的全程控制，尽数属于安全农产品范畴。
三者都有明确的概念界定，有产地环境标准，有生产技术标准，还有产品质量标准，以及包装、标签、运输贮藏标准。
（3）三者都必须经过权威机构认证并实行标志管理。
不同点
02
- 质量标准不同
三类食品，在产地环境方面，所遵循的标准不同，在农业投入品使用方面，所依据的规则不同，在产品质量方面，所执行的标准不同，在加工、储运方面，所掌握的标准、规则也不同。
无公害农产品，其产品质量，达到我国所规定的强制性农产品标准要求，参照国内普通食品卫生标准 。
绿色食品突出安全因素控制，这是一方面，它还强调产品优质与营养，另一方面，其质量安全标准达到发达国家先进水平，并且参照联合国粮农组织和世界卫生组织标准。
依照国际惯例，有机食品以市场化方式来开展运作，执行国际通行的标准，参照欧盟以及国际有机运动联盟所制定的有机农业和产品加工的基本标准 。
三者食品质量等级，是按照有机食品大于绿色食品大于无公害农产品这样的顺序来排序的，其中AA级绿色食品，能够经由国际授权的认证机构进行认证，并且与有机食品实现转换。
- 生产技术体系不同
有机食品是按有机农业生产体系来生产的食品，AA级绿色食品也是按有机农业生产体系来生产的食品，它们在生产过程中，禁用一切化学合成物质，同时禁用转基因技术。
按生态农业与现代农业相互结合的技术体系来生产，A级绿色食品与无公害农产品，允许在限定的范围内使用限量的限定化学合成物质。
- 生产基础不同
有机食品的生产地或原料产地，至少要求3年内未使用任何化学合成物质，AA级绿色食品的生产地或原料产地，同样至少要求3年内未使用任何化学合成物质，当由常规生产向有机生产转换时，要求2至3年的转换期。
当年，A级绿色食品的产地环境检测合格，便可转入生产，此外，无公害农产品的产地环境检测合格，同样能转入生产，则无转换期要求。
- 认证标准不同
认证无公害食品的相关标准乃是禁止使用高毒且高残的农药，同时大力推行使用低毒并低残的农药。
绿色食品的认证标准是推畅减量化使用常规农药、化肥。
有机食品的认证标准最严格：
有机食品在生产加工时，绝对禁止使用农药，绝对禁止使用化肥，绝对禁止使用激素等人工合成物质，并且不允许使用基因工程技术，其它食品则允许有限使用这些物质，并且不禁止使用基因工程技术，如绿色食品对基因工程技术和辐射技术的使用就未作规定。
（2）有机食品，在土地生产转型上，有着严格规定，鉴于某些物质于环境里会残留颇为漫长的一段时间，土地从生产别的食品转变为生产有机食品，需要两到三年的转换期，然而生产绿色食品以及无公害食品，却不存在转换期的硬性要求。
有机食品，在数量方面，有着严格的控制，要求确定地块，定好产量，而生产其他食品，并没有这般严格的要求。
- 认证方式不同
无公害农产品认证方式，是以检查认证作为主要方式，以检测认证作为辅助方式，它是由农业部以及各省市食用农产品安全生产体系办公室进行统一认证的。
参与绿色食品认证，其方式主要是以认证检测去进行认证，中国绿色食品发展中心承担全国绿色食品的统一认证工作以及最终认证审批责任，各省、市、区的绿色食品办公室起到协助认证的作用。
在国家认监委的监督之下，认证有机食品所采用的方式，是由具备认证资质的机构来展开认证。
- 认证机构不同
进行无公害农产品认证管理的机构是农业部农产品质量安全中心，无公害农产品认证包含产地认定以及产品认证这两部分，产地认定是由省级农业行政主管部门来组织实施的，产品认证则是由农业部农产品质量安全中心组织实施的，只有获得无公害农产品产地认定证书的产品才能够去申请产品认证。
绿色食品认证机构，在我国，唯一的那一家是中国绿色食品发展中心，此中心，负责全国绿色食品的，统一认证，以及最终审批。
有机食品认证机构是国家环保总局的国家有机食品发展中心。
