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1. 批准的扣除额是多少？
所谓农产品进项税额抵扣，是指纳税人购买农产品时，不再凭扣税凭证直接抵扣进项增值税，而是按照《农产品进项税额核定试点实施办法》的规定《关于农产品进项税额扣除的规定》（财税[2012]38号）等文件，根据外购农产品销售货物或者提供劳务，按照一定的扣除标准，计算进项税额确定农产品当期扣除额。简单来说，以前纳税人购买农产品时，只要有凭证就可以抵扣农产品。现在，免赔额的金额取决于他们购买的数量。
2、核定扣除方式与原扣除方式的区别
1、扣款时间不同
进项税额抵扣环节由购进环节调整为销售环节（有些情况是生产使用环节，如农产品不构成实物商品而使用时）。
2、计算方法不同
原始扣除方式：区分专用发票和农产品发票；
取得专用发票：农产品投入额等于专用发票上的不含税金额*扣除率；
取得农产品发票：农产品投入额等于含税收购价*扣除率。
核定扣除计算方法：区分工业生产环节、商业环节、服务业环节、不足商品实体和直接销售等。
核定扣除方法
当期允许抵扣的进项税额
输入输出法
当期销售商品数量*农产品单耗*农产品平均收购价格*扣除率/（1+扣除率）
成本法
当前主营业务成本*农产品消耗率*扣除率/（1+扣除率）
参考方法
它不是独立的计算方法，或者是采用投入产出法计算，或者是采用成本法计算。
购买后直接销售
当前销售数量/(1-损失率)*农产品平均收购价格*11%/(1+11%)
购买后用于生产经营，但不足以成为实体。
当前消费量*农产品平均收购价格*11%/(1+11%)
农产品单位消耗数量（投入产出法）、农产品消耗率（成本法）和损失率（收购农产品直接销售）统称为扣除标准。
3. 扣除率不同
农产品投入计算
扣除率
原抵扣方式
11%, 13%
核定扣除方法
6%, 11%, 17%
3、核定扣除的基本计算（以下情况假设所有农产品均已取得合法有效的扣除证明）
1.投入产出方式
例：某企业（增值税一般纳税人）2017年8月1日至8月31日销售巴氏奶1000吨，主营业务成本600万元，行业单位原奶消耗量1.055。收购均价4500元/吨。按照投入产出法，公司本期允许抵扣的进项税额为：
【分析】当期允许抵扣的进项税额=当期销售商品数量*农产品单耗*农产品平均收购价格*抵扣率/（1+抵扣率）=1000×1.055×4500/10000×11%÷（1+11%）=47.04（万元）。
2、成本法
例：某公司（增值税一般纳税人）2017年8月1日至8月31日销售改性奶1000吨，主营业务成本600万元，公司农产品消费率为80%，平均原奶收购价格 价格为4500元/吨。按照成本法，公司本期允许抵扣的进项税额为：
【分析】当期允许抵扣的进项税额=当期主营业务成本*农产品消耗率*扣除率/（1+扣除率）=600×80%×17%÷（1+17 %)=69.74(万元)
3. 购买后直接销售
例：某企业（增值税一般纳税人）是《农产品进项税额抵扣试点实施办法》的试点扣除单位。 2017年10月，企业收购农产品100吨，直销90吨。该批农产品收购单价为每吨40万元，损耗率为5%。当期允许抵扣的进项增值税为：
【分析】当期农产品增值税准予抵扣进项税额=当期销售农产品数量/（1-损失率）×农产品平均收购价格产品×11%/(1+11%)=90/(1-5%)×40×11%/(1+11%)=375.53万元。
4、购买后用于生产经营，但不构成商品实体
例如：某酒厂（一般纳税人）购买原木生产包装材料。 2017年9月，1500立方米原木被用于生产包装材料。平均购房单价为100元/平方米。当月原木可抵扣的进项税额为：
【分析】当期农产品增值税准予抵扣进项税额=当期消费数量*农产品平均收购价格*11%/(1+11% )=1500*100*11%/(1+11%)=14864.86元
4、核定扣除额与原扣除额计算方式的增值税计算比较
例如：某畜牧公司2017年9月销售冰鲜带骨、无骨肉50吨，售价4.8万元/吨。收购羊胴体52吨，其中11%增值税专用发票45张，标明金额120万元，增值税13.2万元；收购农产品发票1000张，收购金额100万元，税率11%。假设畜牧有限公司2017年实行农产品核定扣除，采用投入生产法，农产品单耗为1.0113。 9月应纳增值税如何计算？
在批准扣除之前：
销项税额：50*4.8*11%=26.4万元
进项税额：13.2+100*11%=24.2万元
应缴增值税：26.4-24.2=22000元
批准扣除后：
销项税（计算方法不变）：50*4.8*11%=26.4万元
进项税：
消耗农产品数量=50*1.0113=50.565吨
农产品平均收购价格：（120+13.2+100）/52=44846元
进项税额：=50.565*4.4846*11%/(1+11%)=224700元
应缴增值税：26.4-22.47=39300元
